草甘膦除草剂的机制，是由杂草叶、茎吸收了草甘膦的活性物质，并将该活性下传到根系后，通过其活性物质的作用，阻碍了根系的蛋白质的合成，令根系丧失吸收水分、养分能力而最终导致杂草枯死，但当草甘膦的活性物质接触坭土后，很快就会被土壤中的某些金属离子所钝化而失效。