截至到2018年5月份，深圳还没有直达东莞的地铁，只有从深圳北站乘坐高铁然后在虎门站换乘东莞地铁2号线才能达到。但深圳未来将有3条直达东莞的地铁，分别是：

1、深圳地铁11号线与东莞3号线连接：

深圳地铁11号线为串联西部重要组团的市域快线，线路起于上海宾馆，经福田枢纽、南山、前海、机场、沙井，终止于松岗碧头，线路全长大约55公里，设站18座，计划在东莞海头站或长安步行街站对接。

2、深圳地铁6号线与东莞1号线连接：

深圳地铁6号线为轨道快线，起于深圳科学馆，经深圳北站、龙华、石岩、光明，终止于松岗，线路全长大约50公里，设站26座，计划与东莞碧沙岗站对接。

3、深圳10号线与东莞凤岗镇线站连接：

深圳地铁10号线起自福田口岸站至平湖中心站，全长大约30km，设车站24座，此路线计划在东莞凤岗镇荔林站对接。